API-ZYM and numerical analysis of 16S rRNA gene ıdendified micromonospora ısolates from the Black Sea region

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorKoçak, Fadime Özdemir
dc.contributor.authorGençbay, Talha
dc.contributor.authorTopkara, A Rıdvan
dc.contributor.authorÇil, Elif
dc.contributor.authorIşık, Kamil
dc.date.accessioned2025-05-20T18:40:31Z
dc.date.issued2017
dc.departmentBilecik Şeyh Edebali Üniversitesi
dc.description.abstractÇalışmamızda yeni tür olması muhtemel Micromonospora izolatlarına moleküler ve nümerik metodlar uygulanmıştır. Karadeniz bölgesinden alınan toprak örneklerinden izole edilen farklı aktinomisetlerin izolasyon çalışması farklı izolasyon teknikleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Bakterilerin genomic DNA'sı DNA izolasyon kiti kullanılarak elde edilmiştir. Test izolatlarına ait 16S rRNA gen bölgesi çoğaltımı 27F ve 1525R primerleri ile gerçekleştirilmiştir. İzolatlara ait gen dizileri 800R, MG3F ve MG5F evrensel primerleri ile otomatik dizileme cihazı kullanılarak belirlenmiştir. 16S rRNA gen bölgesi temelli filogenetik ağaçlar MEGA6 programında neighbour-joining, maximum likelihood ve maximum parsimony algorithmaları kullanılarak oluşturulmuştur. Bu çalışmada, toplamda yüz elli bir aktinomiset izolatı elde edilmiş ve bunların farklı aktinomiset gruplarına dahil oldukları belirlenmiştir. Bu izolatlardan Micromonospora cinsine ait olan yeni tür olması muhtemel 11 tanesine nümerik ve biyokimyasal testler uygulanmıştır. Yeni olduğu varsayılan Micromonospora toprak izolatlarının aktinomiset taksonomisine katkı sağlayacağı ve aynı zamanda birçok yeni türün ortaya çıkacağı düşünülmektedir
dc.identifier.endpage92
dc.identifier.issn1308-5301
dc.identifier.issn1308-8084
dc.identifier.issue2
dc.identifier.startpage81
dc.identifier.trdizinid230121
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/230121
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11552/6065
dc.identifier.volume10
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isotr
dc.relation.ispartofBiological Diversity and Conservation
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_TR_20250518
dc.subjectBiyoloji
dc.subjectMikrobiyoloji
dc.subjectBiyoteknoloji ve Uygulamalı Mikrobiyoloji
dc.subjectİstatistik ve Olasılık
dc.titleAPI-ZYM and numerical analysis of 16S rRNA gene ıdendified micromonospora ısolates from the Black Sea region
dc.typeArticle

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar